Bütün ameliyatların olduğu gibi lazerin de komplikasyonları ve yan etkileri olabilir :
– Enfeksiyon
– Göz kuruluğu
– Artık numara kalması en belli başlıcalarıdır. Bunların oluşma ihtimali hastadan hastaya değişir. Lazer sonrası enfeksiyon riski 1/10.000 seviyelerindedir. Diğer komplikasyonların ortaya çıkma sıklığı ise hastaya ve kullanılan yönteme göre değişir.